Genetic Signatures成立於(yu) 2001年,由Geoffrey Grigg博士(原澳大利亞(ya) 聯邦科學與(yu) 工業(ye) 研究組織(CSIRO)分子生物學部主任)創立。甲基化分析中使用廣泛的方法是亞(ya) 硫酸氫鹽法,由Grigg博士在英國劍橋設想,並被減少到CSIRO實驗室的實踐中[1]。初的方法隨後得到改進,這些改進導致了遺傳(chuan) 簽名MethylEasy™亞(ya) 硫酸氫鈉修飾產(chan) 品係列的開發和發布。
由於(yu) 改進的轉化方法和用於(yu) 胞嘧啶甲基化檢測的應用,發現了一個(ge) 有趣的發現:通過亞(ya) 硫酸氫鈉處理微生物能夠將四種核酸堿基還原成僅(jin) 三個(ge) 堿基,通過將胞嘧啶轉化為(wei) 胸腺嘧啶。該技術被稱為(wei) 3base ™,是我們(men) 的EasyScreen ™病原體(ti) 檢測試劑盒的基石。
此後,遺傳(chuan) 標誌開發並商業(ye) 化了一套基於(yu) EasyScreen ™實時PCR的產(chan) 品,用於(yu) 常規檢測傳(chuan) 染病。EasyScreen ™產(chan) 品為(wei) 醫院和病理實驗室提供了分子工具,可在快速高通量的環境中篩查各種傳(chuan) 染性病原體(ti) 。
胃腸疾病可能由各種各樣的感染因素引起,包括病毒,細菌和原生動物。因此,傳(chuan) 染性胃腸疾病的診斷可能具有挑戰性,並且涉及微生物學,病毒學和寄生蟲學方麵的專(zhuan) 家。
據估計,澳大利亞(ya) 每年有1680萬(wan) 胃腸炎病例,導致醫院急診科就診25萬(wan) 人,住院15,000人,死亡80人[1]。
為(wei) 了簡化感染性胃腸道疾病病原體(ti) 的檢測,我們(men) 開發了 EasyScreen™ 實時PCR篩選檢測方法,用於(yu) 所有主要胃腸炎病原體(ti) 。所有的分析方法都采用通用樣品處理方法,並采用我們(men) 之前描述的 3base™ 技術 [2]。
傳(chuan) 統的胃腸炎診斷在某些情況下可能需要長達5天[3]才能提供明確的結果。為(wei) 了減少這種情況,我們(men) 的實驗提供了樣品,可以在3小時內(nei) 完成結果周轉時間。
遺傳(chuan) 特征 EasyScreen ™腸道病原體(ti) 檢測試劑盒具有以下優(you) 點:
該 EasyScreen™ 腸道病原體(ti) 檢測試劑盒包括:
產品# | EasyScreen™套件 | 檢測到微生物 |
---|---|---|
EB001和EB001-HT | 腸道細菌檢測 | (i)沙門氏菌屬 (ii)彎曲杆菌屬(Campylobacter spp。) (iii)痢疾杆菌/腸內侵襲性大腸杆菌(EIEC) (iv)小腸結腸炎耶爾森氏菌。 (v)產毒的艱難梭菌和 (vi)單核細胞增生李斯特菌 |
EP001和EP001-HT | 腸道原生動物檢測 | (i)隱孢子蟲屬, (ii)腸道賈第蟲, (iii)脆弱東部阿米巴, (iv)溶組織內阿米巴,和 (v)人芽囊原蟲(Blastocystis hominis) |
EV002和EV002-HT | 腸道病毒檢測 | (i)諾如病毒GI (ii)諾如病毒GII (iii)星狀病毒 (iv)輪狀病毒A (v )沙波病毒 (vi)腸病毒 (vii)博卡 病毒(viii)腺病毒和 (ix)腺病毒(僅40 + 41) |
CDD001 | 艱難梭菌檢測 | 致病性艱難梭菌(針對tcdA和tcdB) |
CDD002 | 艱難梭菌反射 | 超致病性艱難梭菌包括 (i)位置117處的tcdC基因缺失, (ii)二元毒素基因(cdtA)和 (iii)gyrA基因突變(氟喹諾酮耐藥性)的核糖體027和078 , |
對於(yu) HT(384孔格式)試劑盒,所有試劑盒都足夠用於(yu) 100RXNs或500RXNs。
所有 EasyScreen™ 腸道病原體(ti) 檢測試劑盒可用於(yu) 使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒製備的核酸 。
有關(guan) EasyScreen™ 工作流程以及與(yu) 核酸提取和實時PCR平台的兼容性的更多信息, 請訪問我們(men) 的EasyScreen™ 工作流程頁麵。
[1]來源:澳大利亞(ya) 政府衛生與(yu) 老齡部,“澳大利亞(ya) 食源性疾病的年成本”,2006年3月
[2] Baleriola C,Millar D,Melki J,Coulston N,Altman P,Rismanto N和Rawlinson W.2008。新型HPV測試與(yu) Hybrid Capture II(hcII)和參考PCR方法的比較顯示高特異性和陽性對13例高危人乳頭瘤病毒感染的預測價(jia) 值。J. Clin。病毒學雜誌。42:22-6 2008
[3] Cunningham SA,Sloan LM,Nyre LM,Vetter EA,Mandrekar J和Pa R. 2010.三小時分子檢測糞便中彎曲杆菌,沙門氏菌,耶爾森氏菌和誌賀菌的準確性與(yu) 培養(yang) 物一樣高。J. Clin。微。48:2929-33
英文信息如下:
Product | EasyScreen™ Kit | Microorganisms Detected |
---|---|---|
EB001 & EB001-HT | Enteric Bacteria Detection | (i) Salmonella spp. (ii) Campylobacter spp. (iii) Shigella spp. /Enteroinvasive E.coli (EIEC) (iv) Yersinia enterocolitica. (v) toxigenic C. difficile and (vi) Listeria monocytogenes |
EP001 & EP001-HT | Enteric Protozoan Detection | (i) Cryptosporidium spp. (ii) Giardia intestinalis (iii) Dientamoeba fragilis (iv) Entamoeba histolytica and (v) Blastocystis hominis |
EV002 & EV002-HT | Enteric Viral Detection | (i) Norovirus GI (ii) Norovirus GII (iii) Astrovirus (iv) Rotavirus A (v) Sapovirus (vi) Enterovirus (vii) Bocavirus (viii) Adenovirus and (ix) Adenovirus (40 + 41 only) |
CDD001 | C. difficile Detection | Toxigenic C. difficile (targets both tcdA and tcdB) |
CDD002 | C. difficile Reflex | Hypervirulent C. difficile incl. ribotype 027 & 078 targeting: (i) tcdC gene deletion at position 117, (ii) binary toxin gene (cdtA) and (iii) gyrA gene mutation (fluoroquinolone resistance) |
對於(yu) HT(384孔格式)試劑盒,所有試劑盒都足夠用於(yu) 100RXNs或500RXNs
所有 EasyScreen™ 病原體(ti) 檢測試劑盒都可用於(yu) 使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒準備的 樣品。
有關(guan) EasyScreen™ 工作流程以及與(yu) 核酸提取和實時PCR平台的兼容性的更多信息, 請訪問我們(men) 的 EasyScreen™ 工作流程頁麵。
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