celldatasci使命是使用先進的分子分析技術來挑戰生物樣本，並加強基礎科學和個(ge) 性化醫療的關(guan) 鍵遺傳(chuan) 和基因組數據的恢複。
celldatasci RNAstorm說明書(shu)
福爾馬林固定的組織樣品是RNA提取的挑戰，通常導致可擴增的RNA的低產(chan) 率和在涉及酶操作的後續步驟中的差的性能，包括逆轉錄和測序文庫製備。
RNAstorm™提取試劑盒采用專(zhuan) 有的CAT5™技術，可增強甲醛誘導損傷(shang) 的去除，並為(wei) RNA提供更高的產(chan) 量和質量，更好的完整性和更高的可擴增性。該技術由Cell Data Sciences研究人員開發，基於(yu) 斯坦福大學開展的研究，並於(yu) 2015年在Nature Chemistry上發表。
無論您是進行RNA-seq，qPCR，微陣列還是其他基因表達分析，RNAstorm™試劑盒都是您獲得成功的適合機會(hui) 。
RNAstorm試劑盒為(wei) 從(cong) FFPE樣品中提取高產(chan) 量和高完整性RNA提供了便利的工作流程。
該試劑盒還可與(yu) storm™試劑盒結合使用，從(cong) 同一組織切片中獲得純和RNA。
使用來自各種組織的FFPE樣品的RNAstorm™試劑盒可以看到RNA產(chan) 量和質量的顯著改善（通過可擴增RNA的量來衡量），其年齡範圍從(cong) 1976年到2015年。
NormalLiver 1NormalLiver 2NormalKidneyRenal CellCarcinomaColorectalCancer 1ColorectalCancer 20102030Fold increase in RNA amountRNAstorm™ KitKit Q
通過FFPE組織的定量RT-PCR比較RNA回收率。“Q”代表競爭(zheng) 性商業(ye) FFPE提取試劑盒。
NormalLiver 1NormalLiver 2NormalKidneyRenal CellCarcinomaColorectalCancer 1ColorectalCancer 2020406080DV200 (%)RNAstorm™ KitKit Q
對於(yu) 使用RNAstorm TM試劑盒提取的RNA相對於(yu) 流行的商業(ye) 試劑盒，觀察到增加的DV 200值。DV 200表示使用Agilent Bioanalyzer RNA 6000納米試劑盒測量的長度大於(yu) 200nt的RNA的百分比。
使用來自RNAstorm TM試劑盒和試劑盒Q所見的相同樣品的RNA獲得的BioAnalyzer痕跡的示例性疊加顯示如下。
| 應用 | RNAseq，PCR，qPCR / RT-PCR，微陣列 |
| 套件格式 | 手動（包括20/50旋轉柱）; 磁珠套件即將推出 |
| DNase處理步驟 | 包括 |
| 輸入樣本 | 福爾馬林固定樣品（石蠟包埋或固定劑） |
| 推薦的輸入樣本量 | 1-4節（每節5-10微米） |
| 分離的RNA類型 | 總RNA（包括miRNA） |
| 隔離時間 | 50分鍾的動手時間 |
| 每個套件包括： | 旋轉柱 |
使用RNAstorm™試劑盒獲得的RNA中是否存在任何汙染的基因組？
基因組的汙染是一個(ge) 很大的問題，因為(wei) 它可以幹擾下遊應用。RNAstorm™試劑盒包括優(you) 化的DNase消化步驟，可去除汙染的基因組，而不會(hui) 顯著影響RNA產(chan) 量。雖然此步驟是可選的，但強烈建議您這樣做。
我可以從(cong) FFPE樣本中獲得多少RNA？
影響獲得的RNA總量的大變量是樣品本身的質量（即組織的類型和數量，以及分離和保存樣品時的護理）。使用RNAstorm™試劑盒，並假設至少合理的樣品質量，可以獲得大於(yu) 1微克的量。
使用RNAstorm™試劑盒獲得的RNA可以用於(yu) RNA-Seq嗎？
是。隻要RNA具有足夠高的質量，就可以獲得高質量的文庫。對於(yu) Illumina測序，建議使用至少30％的DV200，並且應使用提供至少1μgRNA的樣品。
如何準備組織？
使用切片機從(cong) FFPE樣品中獲得5-10μm切片。如果可以可靠地切割，則可以使用厚度小於(yu) 5μm的部分。建議不要使用厚度超過10微米的部分，因為(wei) 它們(men) 可能無法*消化。此外，每次提取應使用不超過5個(ge) 部分（每個(ge) 10μM）。使用過多的組織會(hui) 導致消化不*並降低產(chan) 量。
我可以使用非石蠟包埋的組織嗎？
是的，可以使用未包埋在石蠟中的組織。在這種情況下，我們(men) 建議機械研磨相當於(yu) 推薦部分數量的組織。
我可以使用FFPE核心嗎？
是的，可以使用FFPE核心。由於(yu) 核心不使用切片機進行處理，因此如果觀察到不*消化，則推薦樣品消化更加困難並且建議進行機械均質化（例如使用鋼珠）。
你推薦哪種脫蠟方法？
RNAstorm™試劑盒包括推薦的Deparaffinization Reagent。與(yu) 其他常用方法（例如二甲苯）不同，脫石蠟試劑是，無毒的，不需要使用通風櫥。在我們(men) 的測試中，所包含的試劑在去除石蠟和允許純化高質量核酸方麵至少與(yu) 二甲苯一樣有效。
定量從(cong) FFPE樣品中獲得的RNA的適合方法是什麽(me) ？
源自FFPE的RNA比從(cong) 新鮮樣品獲得的RNA更準確地定量。僅(jin) 知道RNA的量是否足夠，以及RNA是否適用於(yu) 下遊應用，這取決(jue) 於(yu) 以下因素：
RIN編號是否應用於(yu) 確定FFPE衍生RNA的質量？
雖然RIN數可以提供有關(guan) 樣品碎片程度的一般信息，但它不是敏感或可預測的，不足以成為(wei) 下遊性能的有用指標，特別是對於(yu) RNA-Seq。通常，FFPE衍生的RNA的RIN數字將在2到3之間。這些樣本中的一些將用於(yu) RNA-Seq，而其他樣本則不會(hui) --RIN不會(hui) 告訴您。
使用Illumina測序在RNA-Seq中稍微更好的預測性是DV200，其代表長於(yu) 200個(ge) 核苷酸的RNA片段的百分比。DV200也是基於(yu) Bioanalyzer數據計算的，但是存在與(yu) 所有基於(yu) 生物分析儀(yi) 的方法相同的缺點，特別是高變異性。
從(cong) FFPE樣品中提取RNA時我需要知道什麽(me) ？
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