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BioChain cfPure®無細胞核酸提取

　更新時間：2020-10-09　點擊量：1345

 

BioChain成立於(yu) 1994年，總部位於(yu) 舊金山灣區。

BioChain是高質量的生物樣品處理產(chan) 品和分析服務的，用於(yu) 推進轉化醫學，伴隨診斷和臨(lin) 床產(chan) 品研發。BioChain的產(chan) 品可用於(yu) 和RNA測序，PCR和RT-PCR，基因表達分析，和RNA純化，蛋白質提取和純化以及蛋白質表達分析。從(cong) 臨(lin) 床樣品收集，樣品製備，測序到生物信息學分析，BioChain的新一代測序一站式服務將*改變整個(ge) 行業(ye) 。

除了我們(men) 生物標本和樣品製備業(ye) 務外，BioChain還涉足臨(lin) 床應用，提供癌症和生殖健康方麵的臨(lin) 床基因組學診斷產(chan) 品和臨(lin) 床試驗服務。BioChain致力於(yu) 通過我們(men) 的持續過程改進計劃以具競爭(zheng) 力的價(jia) 格獲得高質量的產(chan) 品和服務。BioChain建立了全麵的質量保證計劃，以滿足客戶的滿意，並為(wei) 我們(men) 的內(nei) 部生產(chan) 設施維持ISO9001：2015和ISO 13485：2016認證。

BioChain cfPure®無細胞核酸提取

cfPure®無細胞核酸提取的功能

cfPure®無細胞提取試劑盒 是基於(yu) 磁珠的提取試劑盒，旨在從(cong) 人血漿和血清中分離循環的無細胞（cf）。該套件具有快速，簡單和自動化友好的協議，使用戶能夠快速提取高質量的cf，該可用於(yu) 下遊應用，包括實時PCR，數字PCR和下一代測序。

cfPure®無細胞核酸提取

 

高cf的質量，純度和產量

cfPure®無細胞提取試劑盒是BioChain基於(yu) 磁珠的新型提取試劑盒，旨在從(cong) 血漿，血清和尿液中分離循環的無細胞（cf）。該試劑盒提供了一種簡單且自動化友好的協議，使用戶可以從(cong) 一係列樣品量中快速提取高質量的下遊cf。

應用範圍：

從(cong) 血漿，血清和尿液中提取高質量的無細胞，用於(yu) 下一代測序（NGS），亞(ya) 硫酸氫鹽測序，PCR，qPCR，ddPCR和其他苛刻的應用。

優點和特點：

  • 用途廣泛： 從<1mL至> 10mL的血清或血漿中提取–在單管或24至96孔板中
  • 自動化友好： 在KingFisher™和液體處理儀器上，提取過程大約需要50分鍾
  • 高效省時： 手動提取方案隻需不到75分鍾
  • 具有成本效益： 從1毫升血漿中每次提取的*3美元（250毫升試劑盒的標價）
  • 洗脫體積：  15 µL至50 µL

cf試劑盒產(chan) 生可重複的結果

 

血漿ID回收的總（ng）
一種7.00
一種7.05
乙32.45
乙33.50
C26.80
C27.70
d10.90
d10.90

表1.為(wei) 了評估可重複性，使用cfPure®無細胞提取試劑盒從(cong) 4種不同人類供體(ti) 的1 mL血漿中提取，一式兩(liang) 份。

相對於(yu) 競爭(zheng) 的cf的有效回收

提取套件樣品編號每
毫升血漿中回收的cf（ng）
每毫升血漿（ng）115 nt ALU序列cf（通過PCR）
競爭對手T1個4.991.97
BioChain的cfPure1個6.352.53
競爭對手T26.183.21
BioChain的cfPure28.283.93
競爭對手T36.933.79
BioChain的cfPure37.503.87

表2.通過cfPure®無細胞提取試劑盒或競爭(zheng) 對手的基於(yu) 磁珠的無細胞提取試劑盒，從(cong) 來自三個(ge) 不同供體(ti) 的2 mL血漿中純化了cf。通過熒光方法或qPCR使用與(yu) ALU序列互補的引物評估的回收率。

 

 

圖1.cfPure®無細胞試劑盒用於(yu) 從(cong) 5 ml健康人血漿中分離。回收到62 ng的cf（150-200 bp片段），並帶有少量g汙染。

 

 

圖2.使用各種樣品體(ti) 積（.2，.5、1、5、10ml）從(cong) 兩(liang) 個(ge) 人類供體(ti) 的血漿中提取cf。然後通過Qubit高靈敏度測定法定量cf產(chan) 量。相對於(yu) 初始樣本量繪製產(chan) 量，並計算其趨勢線的R 2值。

cf由終用戶通過NGS驗證

通過cfPure萃取cf ® cf Extraction試劑盒是*的下遊應用如NGS。在第三方研究cf從(cong) 10毫升的人血漿用BioChain公司的cfPure提取從(cong) 4個(ge) 供體(ti) ®（B），競爭(zheng) 對手T的（T），和競爭(zheng) 對手Q的（Q，基於(yu) 列的）cf提取試劑盒。然後為(wei) 每個(ge) 樣品構建文庫，並進行全基因組測序。從(cong) 數據分析來看，三種提取方法均未顯示出明顯的性能差異：插入片段大小，作圖率，全基因組覆蓋率，取代率和GC偏倚。

 

 

圖3.相對於(yu) 插入物長度的讀取數。每條曲線代表來自相同提取方法的4個(ge) 樣品的平均值。

 

 

圖4.通過將特定GC含量的讀數數除以所有GC箱的平均讀數數來計算GC箱中的覆蓋率或深度的百分比。數字1表示平均覆蓋率，小於(yu) 1的數字表示低於(yu) 平均覆蓋率，而大於(yu) 1的數字表示高於(yu) 平均覆蓋率。

自動化就緒

cfPure®無細胞提取試劑盒適用於(yu) KingFisher™和液體(ti) 處理儀(yi) 器。借助KingFisher™Flex和BioChain的cfPure®無細胞提取試劑盒，可在50分鍾內(nei) 提取多達96個(ge) 1 ml樣品，或在一小時內(nei) 提取24個(ge) 5 ml樣品。

 

 

圖5.使用KingFisher Flex自動純化係統和BioChain的cfPure®係統（cfPure KingFisher）或競爭(zheng) 對手的試劑盒（Competitor T KingFisher）從(cong) 4 mL EDTA血漿中純化cf。將兩(liang) 種自動提取方法與(yu) 使用cfPure®（cfPure手動）進行的手動提取進行了比較。使用與(yu) ALU重複序列互補的引物通過qPCR評估cf的回收率。

 

 

 

技術指標

樣本類型（常規）：液體樣品（例如血清），ds
高吞吐量兼容性：自動化協議
下遊應用：下一代測序，PCR，實時PCR
生產線：cfPure®
產品尺寸：1套
運輸條件：室內溫度

 

套件內容

K5011610K5011625K5011625MA
2 x 1.33 mL cfPure無細胞磁珠5 x 1.33 mL cfPure無細胞磁珠5 x 1.33 mL cfPure無細胞磁珠
1 x 115 mL cfPure無細胞裂解/結合液3 x 95 mL cfPure無細胞裂解/結合液1 x 95 mL cfPure無細胞裂解/結合液
2 x 55 mL cfPure無細胞洗滌液5 x 55 mL cfPure無細胞洗滌液1 x 65 mL cfPure無細胞洗滌液
1 x 6 mL cfPure無細胞洗脫液1 x 15 mL cfPure無細胞洗脫液1 x 15 mL cfPure無細胞洗脫液

 

引文

 

血液檢測與(yu) PET-CT成像相結合的可行性，以篩查癌症並指導幹預

Lennon AM，Buchanan AH，Kinde I等。

[2020年4月28日在線發布]。 科學。doi：10.1126 / science.abb9601

 

 

  用 重複元素測序評估非整倍性。

Douville C，Cohen JD，Ptak J，Popoli M，Schaefer J，Silliman N，Dobbyn L，Schoen RE，Tie J，Gibbs P，Goggins M，Wolfgang CL，Wang TL，Shih IM，Karchin R，Lennon AM，Hruban RH ，Tomasetti C，Bettegowda C，Kinzler KW，Papadopoulos N，VogelsteinB。

美國國家自然科學委員會(hui) 。2020 Mar 3; 117（9）：4858-4863。doi：10.1073 / pnas.1910041117。Epub 2020 2月19日。PMID：32075918

 

 

遊離 在 癌症： 當前 的見解。

Fettke H，Kwan EM，Azad AA。

Cell  Oncol（Dordr）。2019二月; 42（1）：13-28。doi：10.1007 / s13402-018-0413-5。EPUB 2018年10月26日。評論。

PMID：30367445