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biocat化合物庫簡介

 更新時間:2021-09-15 點擊量:1125

BioCat GmbH 位於(yu) 海德堡科技園,靠近德國癌症研究中心,是一家私營公司,成立於(yu) 2000 年,致力於(yu) 為(wei) 生命科學研究營銷創新產(chan) 品和服務。

BioCat 提供範圍廣泛的高質量研究試劑和儀(yi) 器以及基因組學、蛋白質組學和細胞生物學領域的技術,為(wei) 學術界以及製藥和生物技術行業(ye) 的科學提供動力。

小分子調節劑

小分子調節劑已成為生命科學研究中重要的藥物開發工具,因為它們在調節不同細胞過程(從細胞周期控製和有絲分裂到信號通路和基因表達以及從遷移和傷口愈合到細胞凋亡和自噬)方麵具有顯著優勢。

確定新穎且穩健的化學起點仍然是當今藥物發現的最大挑戰之一。在過去的十年中,在項目的早期階段,在高通量分析中篩選大量化合物以識別那些具有調節目標靶標潛力的化學物質已成為(wei) 普遍做法。與(yu) 靶蛋白結合並調節其生物活性的小分子調節劑具有許多優(you) 點。除了其固有的穩定性、細胞滲透性和生物利用度外,它們(men) 還可以輕鬆操作,並可應用於(yu) 各種細胞或動物實驗。提供了大量熱信號通路的小分子調節劑。

還提供了化合物庫,將化合物分組為(wei) 更小、更高質量的篩選集合。

有前景的抗病毒

根據虛擬篩選結果並結合近期的臨(lin) 床報告,我們(men) 的合作夥(huo) 伴 TargetMol 已獲得一些有前景的 SARS-CoV-2 候選藥物,包括 Remdesivir、Darunavir、Camostat mesilate、Baricitinib、Favipiravir、Ribavirin、二磷酸氯喹和 Nitazoxanide。

biocat化合物庫簡介

化合物庫廣泛用於靶標識別、高通量/聚焦篩選可能開發成藥物的新命中、藥物重新定位/再利用、預測毒理學或通過將小分子化學基因組學與遺傳方法相結合來發現新靶標,例如 RNA 介導的幹擾和 CRISPR/Cas9。

根據其範圍(特定目標或多樣化目標)和設計(化學空間或支架),我們(men) 的合作夥(huo) 伴 TargetMol 開發的化合物庫可分為(wei) 重點生物活性庫、天然產(chan) 物庫、片段庫和多樣性集,見下文. 這些文庫已在其內(nei) 部生物測定中得到廣泛驗證,並被研究機構和製藥公司廣泛用於(yu) 補充篩選策略。確定新穎且穩健的化學起點仍然是當今藥物發現的最大挑戰之一。在過去十年中,在項目的早期階段,通常的做法是在高通量分析中篩選均勻覆蓋較大化學空間部分的大量化合物(多樣性主導的範式),以識別那些有可能調節感興(xing) 趣的目標。這種大規模篩選的成本高昂,因此需要使用主要針對規模和速度進行優(you) 化的簡化分析,以及越來越多地認識到藥物特性空間遠非隨機,最近導致使用更小、更高質量的篩選集合(以目標為(wei) 主導的方法)。所有這些化合物庫及其篩選方法都有其特定的優(you) 點和缺點。因此需要使用主要針對規模和速度進行優(you) 化的還原性分析,以及越來越多地認識到藥物特性空間遠非隨機,最近導致使用更小、更高質量的篩選集合(以目標為(wei) 主導的方法)。所有這些化合物庫及其篩選方法都有其特定的優(you) 點和缺點。因此需要使用主要針對規模和速度進行優(you) 化的還原性分析,以及越來越多地認識到藥物特性空間遠非隨機,最近導致使用更小、更高質量的篩選集合(以目標為(wei) 主導的方法)。所有這些化合物庫及其篩選方法都有其特定的優(you) 點和缺點。

重點生物活性庫

與(yu) 篩選不同集合相比,篩選集中的生物活性庫通常會(hui) 觀察到更高的,並且從(cong) 成功的集中庫篩選活動中獲得的命中簇通常表現出可辨別的結構-活性關(guan) 係,有助於(yu) 跟蹤這些命中。Focused Bioactive Libraries 是藥物篩選、細胞誘導、藥物再利用、機製研究、靶標識別、陽性對照等相關(guan) 研究領域的有力工具。提供 FDA 批準的藥物庫以及抗 COVID19/SARS-CoV-2 庫。

天然產物庫

天然產(chan) 物是化學多樣性來源,也是任何藥理活性小分子篩選計劃的理想起點。從(cong) 曆史看,天然產(chan) 物一直是新藥最成功的來源。天然產(chan) 物庫是細胞誘導研究和藥物篩選的強大工具,重點關(guan) 注*的天然結構和新的生物活性。

片段庫

在過去十年中,基於(yu) 片段的藥物發現 (FBDD) 已成為(wei) 通過高通量篩選 (HTS) 進行傳(chuan) 統先導識別的替代方法。與(yu) HTS 不同,FBDD 識別較小的化合物,即與(yu) 生物靶標不同部分結合的“片段"。FBDD 在發現 2 種批準的藥物(Vemurafenib 和 Venetoclax)和至少 30 種處於(yu) 不同臨(lin) 床開發階段的藥物中發揮了作用。針對這一明顯的藥物發現趨勢,TargetMol 設計了其片段文庫,其中包括一係列*的片段子集:藥物片段文庫、高溶解度片段文庫和特色片段文庫。

多樣性集

在藥物發現高通量篩選中,希望針對嚐試利用盡可能多的適當化學空間的化學物質篩選藥物靶標。化學庫采樣的化學空間越寬,高通量篩選找到“命中"的機會(hui) 就越大——一種在可能被開發成藥物的生物模型中具有適當相互作用的化學物質。所有可能的化學結構的化學空間都非常大。為(wei) 了平衡在大型多樣化化合物庫中篩選數十萬(wan) 種無活性化合物的成本與(yu) 直接從(cong) 篩選數據建立結構-活性關(guan) 係 (SAR) 和增加識別範圍廣泛的命中係列的機會(hui) 等好處之間的平衡,TargetMol 設計了兩(liang) 個(ge) 多樣性集:Mini Scaffold Library 和 Golden Scaffold Library。從(cong) 160 萬(wan) 個(ge) 類藥化合物中選擇,每個(ge) 支架隻有 1 個(ge) 化合物(Mini Scaffold Library,5033 個(ge) 化合物)或 1-3 個(ge) 化合物(Golden Scaffold Library,10000 個(ge) 化合物),這兩(liang) 個(ge) 化合物庫可以降低篩選成本並降低單個(ge) 項目團隊的篩選閾值,同時不會(hui) 丟(diu) 失足夠的信息。在這種情況下,初始篩選之後將需要進一步購買(mai) 複合類似物和篩選以驗證和擴展命中周圍的 SAR。10000個(ge) 化合物)對於(yu) 每個(ge) 支架,這兩(liang) 個(ge) 化合物庫可以降低篩選成本,降低單個(ge) 項目團隊的篩選門檻,同時不會(hui) 損失足夠的信息。在這種情況下,初始篩選之後將需要進一步購買(mai) 複合類似物和篩選以驗證和擴展命中周圍的 SAR。10000個(ge) 化合物)對於(yu) 每個(ge) 支架,這兩(liang) 個(ge) 化合物庫可以降低篩選成本,降低單個(ge) 項目團隊的篩選門檻,同時不會(hui) 損失足夠的信息。在這種情況下,初始篩選之後將需要進一步購買(mai) 複合類似物和篩選以驗證和擴展命中周圍的 SAR。