immaginabiotech iUDI Plate LACEseq說明書(shu)
iUDI Plate LACEseq unique dual index Plate包含用於(yu) 擴增indexed Illumina®兼容NGS文庫的*雙索引PCR引物。這些引物可用於(yu) 需要TruSeq的LACEseq套件中™可共用的
索引引物。
iUDI Plate LACEseq包含索引PCR引物,並提供多達24對*的雙索引,用於(yu) 複用多達24個(ge) 樣本。索引的PCR引物預先分配在96孔PCR板中。每個(ge) 雙指數都有足夠的量,可用於(yu) 5-10個(ge) 反應。
所有指標均已通過功能驗證,可與(yu) 使用雙通道或四通道化學進行堿基調用的Illumina測序係統協同工作。
一般注意事項
A、 最佳做法
•不建議iUDI板LACEseq索引板經曆五次以上的凍融循環。
•使用前,取下蓋子。在室溫下解凍10分鍾,然後將盤子旋轉至試管底部的顆粒內(nei) 容物。確保板在打開前沒有可見的冷凝水。在使用過程中,請將盤子放在冰上。
•準備索引PCR時,使用移液管j端刺穿板的密封,然後直接移取所需體(ti) 積的索引引物。始終為(wei) 每口井使用單獨的吸管頭,以避免指數交叉汙染。使用後再次密封板,以避免溢出。
B、 產(chan) 品兼容性
iUDI板帶
iUDI板LACEseq板設計用於(yu) LACEseqTM和PAGExtTM IMMAGINA產(chan) 品(目錄號#LS-001和目錄號#KGE-002)。請參閱LACEseqTM和PAGExtTM試劑盒特定用戶手冊(ce) ,了解使用iUDI板中提供的索引PCR引物的說明
LACEseq板。引物對未甲基化。
C、 多路複用和解擴
重要的是選擇適當且符合Illumina推薦兼容性要求的單一索引。LACEseq iUDI引物對的指數以四對為(wei) 一組進行顏色平衡
(1-4, 5-8, 9-12,13-16). 每組四個(ge) 索引都是*顏色平衡的,可以合並排序。可以複用的樣本數少於(yu) 四個(ge) ,但在合並之前要驗證顏色平衡。不要跨行共享庫。
我們(men) 不建議將Imagina庫與(yu) 其他供應商的庫在同一個(ge) 序列通道中進行複用。雖然原則上這是可能的,但可能需要對索引組合、庫池條件和加載量進行特定的優(you) 化。對包含不同通道共享的不同庫類型的複雜池進行排序可能會(hui) 對排序運行度量、讀取質量、讀取輸出和/或解複用性能產(chan) 生不可預測的影響。Imagina對在同一通道(或運行)中與(yu) 外部庫類型組合排序的Imagina庫的性能更改不承擔任何責任。
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